Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms