Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ciao1Q99KN2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms