Protein–RNA interactions for Protein: Q99J64

Rbm43, RNA-binding protein 43, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm43Q99J64 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rbm43Q99J64 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rbm43Q99J64 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rbm43Q99J64 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm43Q99J64 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm43Q99J64 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm43Q99J64 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm43Q99J64 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm43Q99J64 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rbm43Q99J64 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm43Q99J64 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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