Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ctu1Q99J10 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctu1Q99J10 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ctu1Q99J10 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ctu1Q99J10 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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