Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms