Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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