Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RestQ8VIG1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RestQ8VIG1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms