Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cabp4Q8VHC5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms