Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rhbdd2Q8VEK2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rhbdd2Q8VEK2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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