Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vmn1r72Q8K3N7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vmn1r72Q8K3N7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r72Q8K3N7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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