Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufs8Q8K3J1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms