Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Prpf39Q8K2Z2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Prpf39Q8K2Z2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Prpf39Q8K2Z2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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