Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nek9Q8K1R7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nek9Q8K1R7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nek9Q8K1R7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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