Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FgbQ8K0E8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FgbQ8K0E8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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