Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc8Q8CFD5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms