Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp27Q8CEG8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp27Q8CEG8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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