Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ccdc113Q8C5T8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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