Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdac7Q8C2B3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms