Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf41Q8BH75 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms