Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
IfnkQ7TSL0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms