Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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