Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtifQ6PEE2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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