Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NipblQ6KCD5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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