Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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