Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprdQ64487 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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