Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clcn1Q64347 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clcn1Q64347 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clcn1Q64347 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clcn1Q64347 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clcn1Q64347 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcn1Q64347 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms