Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc18Q640L5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ccdc18Q640L5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc18Q640L5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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