Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a5Q63ZW6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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