Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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Sall3Q62255 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sall3Q62255 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms