Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kdm5dQ62240 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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