Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga6Q61739 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms