Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cln3Q61124 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cln3Q61124 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms