Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PtprnQ60673 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms