Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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