Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ggnbp2Q5SV77 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ggnbp2Q5SV77 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms