Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

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Length 1,264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tbc1d9Q3UYK3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tbc1d9Q3UYK3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbc1d9Q3UYK3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms