Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms