Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nhlrc4Q3UP44 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms