Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms