Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Otud5Q3U2S4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Otud5Q3U2S4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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