Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Shcbp1lQ3TTP0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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