Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc13Q3TIR1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms