Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RubcnlQ3TD16 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms