Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hddc2Q3SXD3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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