Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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Samd11Q1RNF8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Samd11Q1RNF8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Samd11Q1RNF8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Samd11Q1RNF8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Samd11Q1RNF8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd11Q1RNF8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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