Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3ip1Q149C2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms