Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc1Q0VDN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms