Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vps8Q0P5W1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms