Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc21bQ0HA38 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ttc21bQ0HA38 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc21bQ0HA38 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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