Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Kcnma1Q08460 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Kcnma1Q08460 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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